Die Charterflotte von Korfu operiert von siebzehn Anlegestellen aus, doch die große Mehrheit der privaten Yacht- und Segelbootabfahrten startet in der Gouvia Marina, einem Tiefwasserhafen sechs Kilometer nördlich von Korfu-Stadt, der seit den späten 1970er Jahren Freizeitseglern dient.
Der Hafen wurde aus einem venezianischen Marinearsenal gehauen; Steinkais aus dem 16. Jahrhundert bilden noch heute die östliche Mole. Heute verfügt der Yachthafen über mehr als tausend Liegeplätze, und die Charteranbieter betreiben ein Spektrum an Schiffen von zwanzig Fuß langen RIBs bis zu vierzig Fuß langen Katamaranen, die meist für Tagesausflüge zu den Ionischen Inseln südlich und westlich von Korfu ausgerüstet sind.
Die am häufigsten angefragte private Bootsausflugsroute auf Korfu führt südlich an Korfus Klippen vorbei nach Paxos und Antipaxos, zwei Kalksteininseln zwanzig Kilometer vor der Küste. Paxos ist von Ende zu Ende zehn Kilometer lang; seine Westküste ist von Meereshöhlen durchlöchert – eingestürzte Karstkammern, die nur mit dem Beiboot erreichbar sind – und sein östliches Ufer bietet Schutz für drei Hafendörfer, die um venezianische Kais herum erbaut wurden. Antipaxos, kleiner und unbewohnt, besitzt zwei Sandbuchten, Voutoumi und Vrika, deren karibisch blaues flaches Wasser im Juli und August Hunderte von Tagesausflüglern anzieht, in der Nebensaison jedoch fast leer bleibt. Charterskipper ankern normalerweise vor der Küste und bringen Passagiere mit dem Dingi an Land; die Überfahrt von Gouvia dauert neunzig Minuten unter Segeln, mit dem Motor weniger.
Eine zweite bei privaten Segelbootanbietern beliebte Route führt entlang der Nordwestküste Korfus nach Palaiokastritsa, einem Klosterdorf, das über sechs bogenförmigen Buchten thront. Die Küstenlinie zwischen Gouvia und Palaiokastritsa ist größtenteils straßenlos, und Charterboote machen oft an Meereshöhlen und kleinen Buchten Halt, die vom Land aus nicht erreichbar sind. Die Blauen Grotten bei Palaiokastritsa – nicht zu verwechseln mit der bekannteren Blauen Grotte auf Paxos – werden zwischen zehn Uhr morgens und dem frühen Nachmittag durch gebrochenes Sonnenlicht beleuchtet; Kapitäne legen Ankunftszeiten so, dass sie mit der maximalen Leuchtkraft zusammenfallen.
Die Yachtcharter auf Korfu reichen von halbtägigen Küstentouren bis zu mehrtägigen Passagen, die Kefalonia oder die Albanische Riviera erreichen, obwohl die meisten Anbieter private Buchungen auf Tageslichtstunden und griechische Hoheitsgewässer beschränken. Sonnenuntergangsfahrten, die am späten Nachmittag ablegen, umrunden die Kanoni-Halbinsel und kehren nach Einbruch der Dunkelheit zurück. Ihre Routen werden durch den Anflugweg auf den internationalen Flughafen Korfu beleuchtet, der direkt über der Klosterinsel Vlacherna in einer Höhe von weniger als hundert Metern verläuft.
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