El Puerto Nuevo abrió en 1967 para acomodar cruceros demasiado grandes para los muelles venecianos, y en una década sus muelles de hormigón se convirtieron en el punto de embarque para todos los cruceros por las islas Jónicas que salen de la ciudad de Corfú.
El puerto gestiona cuarenta salidas de ferris al día; sin embargo, entre el tráfico industrial, una flota paralela de kaïkia de madera y modernos catamaranes se abre paso hacia Paxos, Antipaxos y las cavernas de piedra caliza talladas en la costa noroeste de Corfú.
Las salidas de los paseos en barco por la ciudad de Corfú siguen rutas marcadas por la geología y el viento predominante. Las Cuevas Azules —una cadena de grutas al nivel del mar donde la luz del sol refractada convierte el agua de mar en cobalto— se encuentran a dieciocho millas náuticas al norte, alcanzables en noventa minutos a bordo de embarcaciones de casco rápido que bordean la costa. Paxos y Antipaxos, las islas Jónicas más meridionales, requieren una travesía más larga: los operadores programan itinerarios de día completo que incluyen paradas para nadar fondeados en la bahía de Voutoumi, almuerzo servido a bordo y un regreso a última hora de la tarde que sincroniza la aproximación a la Fortaleza Vieja de Corfú con el sol poniente. Las rutas evitan aguas abiertas cuando el meltemi sopla en julio y agosto, siguiendo en su lugar el flanco oriental de la isla, donde las montañas albanesas a veinte kilómetros al otro lado del estrecho difunden el oleaje.
El puerto en sí es primero un puerto de trabajo y después una puerta de entrada turística. Los ferris a Igumenitsa y Brindisi comparten atraque con barcos de carga refrigerada, y la ventana de salida matutina, de 07:30 a 10:00, comprime el embarque en una coreografía de treinta minutos de pasarelas y controles de manifiestos. La mayoría de los operadores agrupan sus embarcaciones en el extremo sur del muelle, cerca del almacén de aduanas y la parada de taxis que sirve a la bahía de Garitsa. Los pocos barcos históricos que aún están en servicio —tréhandiri de aparejo cuadrado que datan de la década de 1940— atracan en el muelle más al norte, donde los humos del diésel se disipan y la vista se abre hacia la isla Vido.
Los cruceros costeros de Corfú se diferencian por duración y destino en lugar de por el tipo de embarcación. Las salidas de medio día desde el puerto deportivo de Gouvia, a cinco kilómetros al norte del Puerto Nuevo, se dirigen a viajeros que priorizan nadar sobre el transporte; los cruceros de día completo a Paxos y las cuevas dedican tres horas a la travesía en aguas abiertas, dejando cuatro para paradas fondeadas. Las salidas al atardecer, las más cortas de la categoría, siguen un circuito de seis millas náuticas desde el Puerto Nuevo hasta Kanoni y de regreso, programado según la luz de octubre que tiñe el Palacio de Achilleion de color oro rosado a las 18:45. Cada itinerario depende del estado del mar: los operadores cancelan sin penalización cuando la altura de las olas en la bocana del puerto supera el metro, un umbral alcanzado de doce a quince días por temporada de verano.
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